El uso de los recursos como favor político con miras electorales.
El castigo a organizaciones indígenas que tomaron distancia,
La discrecionalidad en el manejo de los mismos.
La violación sistemática de las normas.
Durante el periodo 2005-2010, las actividades a nivel local particularmente, estaban financiadas con recursos del Programa Bolivia Cambia Evo Cumple con financiamiento venezolano.
El deterioro de la economía venezolana y la muerte del ex Presidente Hugo Chávez produjeron un descenso en las transferencias al país.
La utilización de lo indígena con fines electorales puede rastrearse por diferentes vías, sin embargo, la del Fondo Indígena puede ser una de las más reveladoras, pues sobre la base de unos objetivos dignos y coherentes que pocos podrían criticar, se gesta una instrumentalización de los movimientos indígenas a gran escala. En este estudio, partimos de la siguiente hipótesis:
En el tiempo, la cantidad de recursos desembolsados fue incrementando. Entre 2011 y 2012 los proyectos alcanzaban poco más de 1 millón de bolivianos, con algunas excepciones. A partir de 2013 la cantidad de proyectos con montos que superan el millón de bolivianos crece sustancialmente, alcanzando en 2015 cifras cercanas a los 9 millones.